A new instrument for microbial epidemiology

Een nieuw instrument voor microbiële epidemiologie: gegevensanalyse van antimicrobiële resistentie

De behandeling van infectieziekten vereist inzicht in de micro-organismen die infectieziekten veroorzaken. Antimicrobiële resistentie (AMR) bij micro-organismen beperkt de behandelingsmogelijkheden en vormt wereldwijd een enorm probleem in de gezondheidszorg. De verspreiding van micro-organismen en hun resistenties, de risicofactoren voor infectie, en de preventieve bestrijdingsmaatregelen van infectieziekten worden bestudeerd binnen het vakgebied van Microbiële Epidemiologie, een kruisbestuiving tussen Epidemiologie en Medische Microbiologie. Voor het analyseren van de verspreiding van micro-organismen en hun resistenties bestond echter nog geen gestandaardiseerde methode. In zijn proefschrift beschrijft Berends de ontwikkeling en het toegepaste gebruik van een nieuw instrument om AMR-data te analyseren: het AMR-pakket voor R. Vanuit meerdere perspectieven worden het AMR-pakket en diens voordelen in context geplaatst: vanuit een technisch perspectief, vanuit het perspectief van infectiemanagement en vanuit een klinisch perspectief. Deze combinatie biedt een gemeenschappelijke basis om te begrijpen in welke mate het AMR-pakket bij zou kunnen dragen aan het veld en hoe het een nieuw uitgangspunt zou kunnen zijn voor toekomstige toepassingen van microbiële epidemiologie, zowel voor klinische analyses als voor wetenschappelijk onderzoek.

Dit proefschrift gaat daarnaast verder in op deze verschillende perspectieven door het gebruik van dit nieuwe instrument te illustreren in epidemiologische studies in de Nederlands-Duitse grensregio, om zodoende het vóórkomen van micro-organismen en hun resistenties op een (eu)regionaal niveau beter te begrijpen.

Concluderend toont Berends in zijn proefschrift de toegevoegde waarde aan van een consistent data-analytisch instrument voor het voorbereiden en analyseren van AMR-data in een regio-overschrijdende benaderingswijze, welke ook gebruikt kan worden in een klinische omgeving om nieuwe inzichten in resistentiepatronen te verkrijgen.

CV Matthijs Berends

Matthias (Matthijs) Simeon Berends (1985) studeerde van 2002 tot 2005 Verpleegkunde en stapte daarna over naar Medische Biologie (Life Science and Technology) in Groningen waar hij in 2011 afstudeerde. Van 2011 tot 2014 werkte hij bij het Laboratorium voor Infectieziekten (nu Certe) in Groningen als bacteriologisch analist en begon in 2014 een functie als medisch data-onderzoeker bij Certe. In de jaren daarna specialiseerde hij zich in microbiële epidemiologie en toegepaste statistiek, waarna hij in 2017 naast zijn fulltimebaan bij Certe een promotietraject startte aan de Rijksuniversiteit Groningen bij prof. dr. Alex Friedrich. Tijdens zijn promotietraject volgde hij tevens de opleiding tot epidemioloog aan de Rijksuniversiteit Groningen en de Carl von Ossietzky Universiteit te Oldenburg, Duitsland. De titel van zijn proefschrift luidt: A New Instrument for Microbial Epidemiology: Empowering Antimicrobial Resistance Data Analysis.

Proefschrift: http://hdl.handle.net/11370/b65fdfa6-0bb7-4380-a7da-360d6e4d693e