Insights into the diversity of the endophytic community in potatoes and factors affecting this diversity
De diversiteit van de endofytische gemeenschap in aardappelen
Plant-microbioominteracties zijn inmiddels uitgegroeid tot een cruciaal onderwerp binnen het veld van duurzaam landbouwbeheer. De rol van het plantmicrobioom in het bevorderen van plantengroei en het behouden van plantgezondheid is goed onderzocht. In deze thesis richt promovendus Jyotsna Nepal zich specifiek op het endofytische microbioom, dat vaak over het hoofd wordt gezien, maar essentiële functies vervult zoals bescherming tegen plagen en ziekten, nutriëntenmobilisatie en stress-tolerantie bij planten. Met behulp van resultaten uit gecontroleerde kasexperimenten onderzoekt en benadrukt Nepal de belangrijke rol van bodem in het bepalen van de samenstelling van bacteriële en schimmelendofyten.
Tevens wordt in dit hoofdstuk het sterkere effect van aardappelrassen op de vorming van schimmelendofyten benadrukt. Bovendien suggereert dit dat strategieën die gericht zijn op het manipuleren van bacteriële gemeenschappen in veredelingsprogramma’s mogelijk niet dezelfde resultaten opleveren voor schimmelgemeenschappen. Het verklaart ook de impact van het bodemmicrobioom door het effect ervan los te koppelen van de fysisch-chemische eigenschappen van de bodem, door gebruik te maken van verschillende bodemgemeenschappen. Het laat zien dat het effect van het bodemmicrobioom niet beperkt is tot het bulk- en rhizosfeercompartiment, maar zich ook uitstrekt tot het endofytische compartiment van de plant. Bovendien blijkt hieruit dat de samenstelling van de rhizosfeergemeenschap geassocieerd is met het ontwikkelingsstadium van de plant. Bovendien toont dit proefschrift aan dat het effect van deterministische processen in de opbouw van microbiële gemeenschappen kan toenemen naarmate de plant groeit.