A missing link in microbial ecology? Unpacking the soil mobilome over a century-long soil chronosequence
Een ontbrekende schakel in de microbiële ecologie?
Microbiële gemeenschappen vormen de basis van een gezond ecosysteem, maar ons begrip van hoe zij zich aanpassen aan veranderingen in hun omgeving is nog beperkt. Dit proefschrift onderzoekt de "verborgen kracht" achter deze aanpassing: Mobiele Genetische Elementen (MGE’s) die worden uitgewisseld via Horizontale Genoverdracht (HGT). Deze mechanismen stellen microben in staat zich snel aan te passen aan nieuwe omstandigheden.
Aan de hand van een goed gedocumenteerde bodemchronosequentie (een reeks bodems van verschillende leeftijden) onderzoekt deze studie hoe microben veerkrachtig blijven. Het onderzoek belicht eerst de verspreiding van antimicrobiële resistentie (AMR) binnen het One Health-raamwerk. Vervolgens wordt ingezoomd op de bacterie Pseudomonas, waarbij wordt gekeken naar specifieke genetische patronen tijdens bodemontwikkeling. Daarnaast vergelijkt het proefschrift de rol van extracellulaire dragers van genetisch materiaal, zoals virusachtige deeltjes (VLP’s) en extracellulaire vesikels (EV’s).
Een belangrijke bevinding is het voorgestelde "tweevoudige raamwerk": VLP’s zorgen voor genetische vernieuwing (innovatie), terwijl EV’s bijdragen aan het behoud van genomische stabiliteit. Dit evenwicht tussen vernieuwing en behoud stelt microbiële gemeenschappen in staat om te floreren in een zich ontwikkelend ecosysteem.