A proteogenomic view on antibiotic resistance in pathogenic Enterobacter species
| Promotie: | Mw. S. (Suruchi) Nepal |
| Wanneer: | 27 november 2019 |
| Aanvang: | 12:45 |
| Promotors: | prof. dr. J.M. (Jan Maarten) van Dijl, prof. dr. J.W.A. (John) Rossen |
| Copromotor: | dr. D. Bathoorn |
| Waar: | Academiegebouw RUG |
| Faculteit: | Medische Wetenschappen / UMCG |
Gecombineerde DNA- en eiwitanalyse onthult geheimen van antibioticaresistente Enterobacteriaceae-bacteriën
Bacteriën van het geslacht Enterobacteriaceae veroorzaken nare ziektes, zoals bloedbaaninfecties, longontstekingen en infecties van de buikholte en urinewegen. We kunnen deze bacteriën nu gelukkig nog bestrijden met antibiotica. Er ontstaan echter steeds meer varianten van Enterobacteriaceae die ongevoelig worden voor antibiotica. Dit geldt zelfs voor carbapenems, de zeer effectieve antibiotica die we nu als laatste redmiddel gebruiken. In dit proefschrift onderzoekt Nepal Enterobacteriaceae-bacteriën, die resistentie tegen carbapenems laten zien of ongebruikelijk betrokken waren bij botinfecties, om meer duidelijkheid te krijgen over de achterliggende mechanismes.
Om deze mechanismes te kunnen begrijpen onderzocht Nepal de moleculaire opbouw van de bacterie, met name de genetische opbouw en de eiwitsamenstelling. Zo ontrafelde ze de DNA-sequentie van de bacterie en werd een mobiel genoomeiland ontdekt met uiteenlopende resistentiegenen. Ook vond Nepal verschillende eigenschappen in de bacterie die resistentie in de hand werken, zoals een verminderde antibioticumopname, een vertraagd metabolisme, verlaagde vorming van reactieve zuurstofvarianten en verhoogde antioxidantproductie. De bacteriën die betrokken waren bij botinfecties bleken wel gevoelig voor de meeste antibiotica. Nepal hoopt dat deze resultaten bijdragen aan een beter begrip van de resistentiemechanismen en in de toekomst wellicht aan een betere bestrijding van Enterobacteriaceae.
Curriculum Vitae
Suruchi Nepal (1987) studeerde Farmacie aan de Universiteit van Kathmandu, Nepal, en een master Medical and Pharmaceutical Drug Innovation aan de Rijksuniversiteit Groningen. Tijdens haar promotieonderzoek was zij verbonden aan de afdeling Medische Microbiologie van het Universitair Medisch Centrum Groningen. Inmiddels is ze werkzaam bij Thermo Fisher Scientific. De titel van haar proefschrift luidt: “A proteogenomic view on antibiotic resistance in pathogenic Enterobacter species”.