Increasing the molecular diagnostic yield in genetic diseases using spinocerebellar ataxia (SCA) as a disease model

Het verhogen van de moleculaire diagnostische opbrengst bij genetische ziekten met behulp van spinocerebellaire ataxie (SCA) als ziektemodel

Spinocerebellaire ataxie (SCA's) is een groep genetische aandoeningen die evenwichtsverlies, veranderingen in lichaamsbewegingen en spraakproblemen veroorzaken. Voor SCA-patiënten worden genetische tests uitgevoerd om de oorzaak van de ziekte te vinden. Echter, voor ongeveer 40% van de patiënten blijft de genetische oorzaak onbekend. In haar proefschrift heeft Ghorbani verschillende strategieën toegepast om tot meer genetische diagnoses te komen.

Eerst bestudeerde ze een cohort van onopgeloste patiënten op genetische variaties in alle genen waarvan bekend is dat ze betrokken zijn bij de ontwikkeling van SCA. Bij 22 patiënten werd de genetische oorzaak gevonden. Een grote uitdaging in de diagnostiek is dat ook genetische variatie opgespoord werd van "onbekende betekenis" voor de patiënt. Ghorbani heeft verschillende tests uitgevoerd om de betekenis van een aantal van deze varianten te onthullen. Vier varianten lijken ziekteverwekkend, wat leidt tot een genetische diagnose bij vier patiënten. Daarnaast heeft ze haar cohort getest op een recent ontdekte ziekteverwekkende genvariatie (RFC1 intronische herhalingsexpansie) en vond ze de genetische oorzaak voor tien patiënten. Met een andere benadering identificeerde ze klinisch relevante gendeleties in twee onopgeloste gevallen. Ten slotte zijn genomische regio's geïdentificeerd die de activiteit reguleren van SCA-genen, maar er zijn geen potentieel ziekteverwekkende varianten in deze regio's gedetecteerd.

Concluderend heeft Ghorbani, door verschillende benaderingen te gebruiken, de genetische oorzaak voor 38 SCA-patiënten geïdentificeerd. Hoewel er nog steeds een groot aantal patiënten zonder genetische diagnose overblijft, hoopt Ghorbani met de voortdurende vooruitgang in het veld dat er meer patiënten zullen worden geholpen.

CV Fatemeh Ghorbani

Fatemeh Ghorbani 1987 studeerde Cellulaire en Moleculaire Biologie aan de Universiteit van Isfahan, Iran. Daarna startte ze met het onderzoeksprogramma Medical Pharmaceutical Drug Innovation aan de Rijksuniversiteit Groningen. Tijdens deze master liep ze stage bij het Welcome Trust Sanger Institute in Cambridge, Engeland. Haar promotieonderzoek vond plaats bij de afdeling Genetica van het Universitair Medisch Centrum Groningen (UMCG). Momenteel is zij werkzaam als postdoctoraal onderzoeker bij het European Research Institute for the Biology of Ageing (ERIBA) van het UMCG, waar ze veroudering bestudeert met behulp van Lifelines-gegevens. De titel van haar proefschrift luidt: Increasing the molecular diagnostic yield in genetic diseases using spinocerebellar ataxia (SCA) as a disease model.

Proefschrift: https://hdl.handle.net/11370/5f2f01da-4973-4f5e-9c5d-8298d3db1d09