A fight against viral infections: host factors and antiviral therapies against positive-strand RNA viruses
Een gevecht tegen virale infecties: gastheerfactoren en antivirale therapieën tegen positiefstrengige RNA-virussen
Virale uitbraken kunnen verwoestende gevolgen hebben voor zowel de menselijke gezondheid als de maatschappij. Om effectieve antivirale behandelingen te ontwikkelen, is het belangrijk om de interacties tussen de gastheer en het virus op moleculair niveau te begrijpen. In het eerste deel van haar proefschrift onderzocht Dinesh Kumar de relatie tussen door muggen overgedragen virussen zoals chikungunya-virus (CHIKV), dengue (DENV), het Zika-virus (ZIKV) en West Nile-virus (WNV), en autofagie, een cellulaire afbraakroute. Ze ontdekte dat de rol van autofagie en autofagie-gerelateerde eiwitten (ATG) kan variëren afhankelijk van het virus. Depletie van BNIP3 resulteerde bijvoorbeeld in een toename in CHIKV-replicatie, wat suggereert dat BNIP3 een nieuw gastheerfactor is dat CHIKV remt. Bovendien verlaagde knock-out van ATG7 en ATG16L1 de productie van virale deeltjes van DENV-2, wat wijst op een pro-virale rol van deze eiwitten in de DENV-2-replicatiecyclus.
In het tweede deel van dit proefschrift onderzocht Dinesh Kumar de effectiviteit van enkele antivirale middelen tegen SARS-CoV-2. Ze ontdekte dat boceprevir β-coronavirussen kan remmen door te binden aan de katalytische pocket van de SARS-CoV-2 3CLpro-protease. Resveratrol en pterostilbeen remden de productie van SARS-CoV-2 deeltjes door in te grijpen op post-entry-stadia van de replicatiecyclus.
Over het algemeen biedt dit proefschrift nieuwe inzichten in de moleculaire mechanismen van door muggen overgedragen virussen en beschrijft potentiële mogelijkheden voor het ontwikkelen van antivirale therapieën tegen SARS-CoV-2.
CV Nilima Dinesh Kumar Nilima Dinesh Kumar (1988) studeerde Biotechnologie aan het Vellore Institute of Technology, India, en behaalde daarna haar master in Biochemie en Moleculaire Biologie aan de Universiteit van Bremen, Duitsland. Daarna werkte ze als onderzoeksassistent bij het Max Planck Instituut voor Mariene Microbiologie. Haar promotieonderzoek vond plaats bij de afdeling Biomedische Wetenschappen van Cellen & Systemen en de afdeling Medische Microbiologie en Infectiepreventie van het Universitair Medisch Centrum Groningen. Sinds november 2022 houdt ze zich als postdoc bezig met het ontwikkelen van in vitro respiratoire organoïde modellen om de werkzaamheid van het influenza A-virus (IAV) vaccin te bestuderen.
De titel van haar proefschrift luidt: A fight against viral infections: host factors and antiviral therapies against positive-strand RNA viruses.