Interactions of Burkholderia terrae with soil fungi

Bacterie-schimmel interacties voor een vruchtbare en gezonde bodem

Voor de kwaliteit, vruchtbaarheid en gezondheid van de bodem is de interactie tussen bacteriën en schimmels heel belangrijk. Het werk van Irshad Ul Haq draagt bij aan een beter begrip van deze interacties. Haq richtte zich vooral op de interactie van de bodembacterie Burkholderia terrae met de schimmels Lyophyllum sp. stam Karsten en Trichoderma asperellum 302. In het bijzonder bestudeerde hij de strategieën die B. terrae gebruikt om met bodemschimmels te interageren. Uit zijn analyse bleek dat B. terrae de genetische informatie bezit nodig voor succesvolle interactie met deze schimmels. De bacterie blijkt zich bijvoorbeeld te kunnen hechten op een bepaalde plek van de schimmel en ook kan hij zich naar de schimmel toe bewegen op aantrekkingskracht van chemische stoffen die deze afgeeft.

Met name flagellaire motiliteit en chemotaxis, eiwitsecretiesystemen, biofilmvormingsgenen en genen voor secundaire metabolietsynthese werden gevonden. In aanwezigheid van Lyophyllum sp. stam Karsten, vertoonde B. terrae expressie van genen die verantwoordelijk zijn voor chemotaxis, energiegenerering en een oxidatieve stressrespons. Ook vond Haq dat B. terrae de aanwezigheid van schimmels waarnam, aan de hand van door de schimmels vrijgegeven verbindingen (chemoattractanten), waaronder oxaalzuur en glycerol. B. terrae vertoonde positieve chemotaxis naar deze verbindingen. Met betrekking tot de fysische interactie van B. terrae met de schimmel(s), heeft Haq aangetoond dat de bacterie zich  kon hechten aan één van de ankerplaatsen aanwezig op het celoppervlak van Lyophyllum sp. stam Karsten. Het werk van Haq draagt derhalve bij aan een beter begrip van de bacteriële interacties met schimmels in de bodem en benadrukt het belang van bacterie-schimmel interacties voor de kwaliteit en de gezondheid van de bodem.

Irshad Ul Haq promoveert aan de RUG op onderzoek dat hij uitvoerde bij de afdeling Microbiële Ecologie van GELIFES. Het werd gefinancierd door EU Marie Curie (Trainbiodiverse).

Proefschrift: http://hdl.handle.net/11370/4aacb0b2-3a3c-47fb-ad3a-aca36e55b950