Skip to ContentSkip to Navigation
OnderzoekZernike (ZIAM)News

Organized but intermittent: a liquid mimicking disordered proteins

18 mei 2017

Proteins, the engines of life, form the basis for all vital functions in all living systems. Most commonly, the biological functions of the proteins are imposed by their well-defined structures. This is not the case, however, for the so-called intrinsically disordered proteins (IDP), which e.g. are involved in DNA repair. In IDPs, the structural motifs are labile, rapidly fluctuating between conformations, which makes them very challenging to study.

A liquid mimicking disordered proteins
A liquid mimicking disordered proteins

The Theory of Condensed Matter and Optical Condensed Matter Physics groups (both Zernike Institute for Advanced Materials) together with colleagues from the University of Amsterdam joined efforts to mimic the properties of IDPs with a liquid consisting of the building block of proteins, the molecule N-methylacetamide (NMA). The dynamical properties of NMA were studied using combined computational and experimental ultrafast spectroscopy, which probes fast phenomena from a femto- to the pico-second timescale. Surprisingly, NMA molecules interacting via hydrogen bonds form fragile transient chain-like structures, which have been identified from their unique spectroscopic signature. Our ability to distinguish such chains provides the excellent potential for identifying similar organized but intermittent structures in IDPs.

The results of this work are published in the Journal of Physical Chemistry Letters (A. V. Cunha, E.  Salamatova, R. Bloem, S. Roeters, S. Woutersen, M. S. Pshenichnikov, and T.L.C Jansen, “Interplay Between Hydrogen Bonding and Vibrational Coupling in Liquid N-Methylacetamide”, J. Phys. Chem. Lett., 2017, 8, 2438–2444 DOI: 10.1021/acs.jpclett.7b00731

http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jpclett.7b00731).

You may also want to have a look at the JPC Letters Spotlight related to the article.

Laatst gewijzigd:12 juni 2017 13:37

Meer nieuws

  • 28 november 2017

    Samenwerking gemeenten bespaart geen geld

    Anders dan gedacht verlaagt samenwerking tussen gemeenten de uitgaven van gemeenten niet. Ook leidt samenwerking niet tot een meetbare verbetering van de gemeentelijke voorzieningen. Dat schrijven Maarten Allers en Tom de Greef van het Centrum voor...

  • 27 november 2017

    #PanoramaRomantica in het Groninger Museum

    Speciaal voor de aanstaande tentoonstelling De Romantiek in het Noorden en de huidige expositie Ook Romantiek in het Groninger Museum, heeft het Reality Center van de Rijksuniversiteit Groningen een virtueel panorama ontwikkeld: #PanoramaRomantica....

  • 25 november 2017

    RUG en Noordelijke Online Ondernemers lanceren Groningen Digital Business Centre

    De Rijksuniversiteit Groningen en de Noordelijke Online Ondernemers (NOO) slaan de handen ineen om de bloeiende digitale sector in Noord-Nederland uit te bouwen en te versterken. Samen lanceren zij het Groningen Digital Business Centre (GDBC), een nieuw...