Protein crystallography for computation-supported enzyme redesign
| Promotie: | N. (Nikolas) Capra, MSc |
| Wanneer: | 02 april 2024 |
| Aanvang: | 11:00 |
| Promotors: | prof. dr. D.B. Janssen, prof. dr. ir. M.W. (Marco) Fraaije |
| Copromotor: | dr. A.M.W.H. (Andy-Mark) Thunnissen |
| Waar: | Academiegebouw RUG |
| Faculteit: | Science and Engineering |
Structurele analyse als validatiemethode voor computationele eiwitontwerpstrategieën
Het groeiende bewustzijn van de gevolgen van de industriële chemie voor het milieu heeft geresulteerd in een zoektocht naar duurzame alternatieven voor conventionele chemische synthese reacties, die vaak bij hoge temperatuur en druk verlopen en het gebruik van organische oplosmiddelen en giftige katalysatoren vereisen. Dit heeft geresulteerd in een toenemende belangstelling voor biokatalyse, inclusief eiwit engineering om natuurlijke enzymen aan te passen aan specifieke reactietypen en procesomstandigheden.1,2 Enzymen zijn ideale katalysatoren omdat ze zeer efficiënt en effectief zijn in het versnellen van chemische reacties, vaak uitstekende substraat- en productselectiviteit hebben en makkelijk beschikbaar zijn via expressie door middel van recombinant-DNA-technologie.
De belangrijkste focus van het proefschrift van Nikolas Capra ligt op de toepassing van structurele analyse als validatiemethode voor computationele eiwitontwerpstrategieën. Capra onderzocht de structuur-functierelaties van enzymen, en hoe röntgenkristallografie wordt gebruikt om theoretisch ontworpen mutaties - om de stabiliteit of katalytische eigenschappen van enzymen te verbeteren - kritisch te valideren .