Exploration of energy–coupling factor transporters as a novel antimicrobial target
De energy-coupling factor (ECF)-transporters als nieuw antimicrobieel doelwit
De wereldwijde toename van antimicrobiële resistentie vormt een voortdurende bedreiging doordat gangbare antibiotica bacteriële infecties niet meer effectief kunnen behandelen. Micro-organismen kunnen zich aanpassen en behandelingen uiteindelijk ontwijken, wat leidt tot het ontstaan van multiresistente stammen. Daarom is er behoefte aan de ontdekking van nieuwe antimicrobiële verbindingen met unieke werkingsmechanismen, evenals nieuwe doelwitten. De energy-coupling factor (ECF)-transporters vormen zo’n potentieel nieuw antimicrobieel doelwit.
ECF-transporters zijn een familie van transmembraaneiwitten die de opname van essentiële vitaminen in bacteriën mogelijk maken en afwezig zijn bij de mens. Deze eigenschappen maken ECF-transporters zeer aantrekkelijke doelwitten voor de ontwikkeling van nieuwe antimicrobiële verbindingen.De focus van Spyros Bousis' proefschrift is het leveren van bewijs voor het belang van ECF-transporters en de identificatie en optimalisatie van remmers die hierop aangrijpen.
Allereerst geeft Bousis een overzicht van ECF-transporters als nieuw antimicrobieel doeleiwit, samen met belangrijke auxotrofe pathogenen die ervan afhankelijk zijn. Verder beschrijft hij de ontwikkeling van een nieuwe functionele celgebaseerde assay om remmers van ECF-transporters te screenen en te valideren. Ook rapporteert Bousis een structuurgebaseerde optimalisatie van kleine molecuulremmers van ECF-transporters, nadat onlangs een nieuwe ligand werd ontdekt. Tot slot beschrijft Bousis de expressie en karakterisering van de ECF-transporter voor pantothenaat uit Streptococcus pneumoniae. Daarnaast gebruikte hij een surface plasmon resonance (SPR)-assay om remmers te screenen, gevolgd door een evaluatie van de eiwitstabiliteit met behulp van een thermische shift-assay.
Spyros Bousis voerde zijn onderzoek uit bij het Stratingh Institute for Chemistry, met financiering van de ERC.