Skip to ContentSkip to Navigation
Rijksuniversiteit Groningenfounded in 1614  -  top 100 university
Sluiten
Over ons Praktische zaken Waar vindt u ons P. (Patrick) Deelen
University Medical Center Groningen

P. (Patrick) Deelen

Speerpunten Publicaties Pers/media

Speerpunten

Ik ben vooral geïnteresseerd in het verbeteren van de diagnostische opbrengst van genoom sequencing van patiënten met een zeldzame ziekte. Ik doe dit door populatiegenetica en transcriptomics te integreren.

Publicaties

Improving the diagnostic yield of exome-sequencing by predicting gene-phenotype associations using large-scale gene expression analysis

Deelen, P., van Dam, S., Herkert, J. C., Karjalainen, J. M., Brugge, H., Abbott, K. M., van Diemen, C. C., van der Zwaag, P. A., Gerkes, E. H., Zonneveld-Huijssoon, E., Boer-Bergsma, J. J., Folkertsma, P., Gillett, T., van der Velde, K. J., Kanninga, R., van den Akker, P. C., Jan, S. Z., Hoorntje, E. T., Te Rijdt, W. P. & Vos, Y. J.& 7 anderen, Jongbloed, J. D. H., van Ravenswaaij-Arts, C. M. A., Sinke, R., Sikkema-Raddatz, B., Kerstjens-Frederikse, W. S., Swertz, M. A. & Franke, L., 28-jun.-2019, In: Nature Communications. 10, 1, 13 blz., 2837.

Onderzoeksoutput › › peer review

Identification of context-dependent expression quantitative trait loci in whole blood

Pital-Zhernakova, D., Deelen, P., Vermaat, M., van Iterson, M., van Galen, M., Arindrarto, W., van 't Hof, P., Mei, H., van Dijk, F., Westra, H.-J., Bonder, M. J., van Rooij, J., Verkerk, M., Jhamai, P. M., Moed, M., Kielbasa, S. M., Bot, J., Nooren, I., Pool, R. & van Dongen, J.& 27 anderen, Hottenga, J. J., Stehouwer, C. D. A., van der Kallen, C. J. H., Schalkwijk, C. G., Zhernakova, A., Li, Y., Tigchelaar, E. F., de Klein, N., Beekman, M., Deelen, J., van Heemst, D., van den Berg, L. H., Hofman, A., Uitterlinden, A. G., van Greevenbroek, M. M. J., Veldink, J. H., Boomsma, D. I., van Duijn, C. M., Wijmenga, C., Slagboom, P. E., Swertz, M. A., Isaacs, A., van Meurs, J. B. J., Jansen, R., Heijmans, B. T., 't Hoen, P. A. C. & Franke, L., jan.-2017, In: Nature Genetics. 49, 1, blz. 139-145 7 blz.

Onderzoeksoutput › › peer review

Calling genotypes from public RNA-sequencing data enables identification of genetic variants that affect gene-expression levels

Deelen, P., Zhernakova, D. V., de Haan, M., van der Sijde, M., Bonder, M. J., Karjalainen, J., van der Velde, K. J., Abbott, K. M., Fu, J., Wijmenga, C., Sinke, R. J., Swertz, M. A. & Franke, L., 27-mrt.-2015, In: Genome medicine. 7, 1, 13 blz., 30.

Onderzoeksoutput › › peer review

Low-cost generation of clinical-grade, layperson-friendly pharmacogenetic passports using oligonucleotide arrays

Lifelines NEXT cohort study, Lanting, P., Warmerdam, R., Slager, J., Brugge, H., Ochi, T., Benjamins, M., Lopera-Maya, E., Jankipersadsing, S., Gelderloos-Arends, J., Teuben, D., Hendriksen, D., Charbon, B., Johansson, L., Munnink, T. O., de Boer-Veger, N., Wilffert, B., Swertz, M., Touw, D. & Deelen, P.& 3 anderen, Knoers, N., Dekens, J. & Franke, L., 1-apr.-2025, (E-pub ahead of print) In: American Journal of Human Genetics.

Onderzoeksoutput › › peer review

Author Correction: Symptoms and quality of life before, during, and after a SARS-CoV-2 PCR positive or negative test: data from Lifelines (Scientific Reports, (2023), 13, 1, (11713), 10.1038/s41598-023-38223-5)

Lifelines Corona Research initiative, Goërtz, Y. M. J., Spruit, M. A., Van Herck, M., Dukers-Muijrers, N., van der Kallen, C. J. H., Burtin, C. & Janssen, D. J. A., dec.-2024, In: Scientific Reports. 14, 8390.

Onderzoeksoutput

Co-expression in tissue-specific gene networks links genes in cancer-susceptibility loci to known somatic driver genes

Urzúa-Traslaviña, C. G., van Lieshout, T., Boulogne, F., Domanegg, K., Zidan, M., Bakker, O. B., Claringbould, A., de Ridder, J., Zwart, W., Westra, H. J., Deelen, P. & Franke, L., 15-jul.-2024, In: BMC Medical Genomics. 17, 14 blz., 186.

Onderzoeksoutput › › peer review

Identification of rare disease genes as drivers of common diseases through tissue-specific gene regulatory networks

Bakker, O. B., Claringbould, A., Westra, H. J., Wiersma, H., Boulogne, F., Võsa, U., Urzúa-Traslaviña, C. G., Mulcahy Symmons, S., Zidan, M. M. M., Sadler, M. C., Kutalik, Z., Jonkers, I. H., Franke, L. & Deelen, P., dec.-2024, In: Scientific Reports. 14, 13 blz., 30206.

Onderzoeksoutput › › peer review

Phenotype prediction using biologically interpretable neural networks on multi-cohort multi-omics data

Bios Consortium , van Hilten, A., van Rooij, J., Ikram, M. A., Niessen, W. J., van Meurs, J. B. J. & Roshchupkin, G. V., dec.-2024, In: npj Systems Biology and Applications. 10, 10 blz., 81.

Onderzoeksoutput › › peer review

Picalo: principal interaction component analysis for the identification of discrete technical, cell-type, and environmental factors that mediate eQTLs

Vochteloo, M., Deelen, P., Vink, B., Bios Consortium , Tsai, E. A., Runz, H., Andreu-Sánchez, S., Fu, J., Zhernakova, A., Westra, H.-J. & Franke, L., 2024, In: Genome Biology. 25, 1, 29.

Onderzoeksoutput › › peer review

Brain expression quantitative trait locus and network analyses reveal downstream effects and putative drivers for brain-related diseases

de Klein, N., Tsai, E. A., Vochteloo, M., Baird, D., Huang, Y., Chen, C. Y., van Dam, S., Oelen, R., Deelen, P., Bakker, O. B., El Garwany, O., Ouyang, Z., Marshall, E. E., Zavodszky, M. I., van Rheenen, W., Bakker, M. K., Veldink, J., Gaunt, T. R., Runz, H. & Franke, L.& 1 anderen, Westra, H. J., mrt.-2023, In: Nature genetics. 55, 3, blz. 377-388 12 blz.

Onderzoeksoutput › › peer review

Pers/media

Followed lockdown rules? It may have been your genetics, says new research

Deelen, P.

22/05/2022

Pers / media: Expert Comment ›

Genetic regulation of blood cells: Proximity of a gene to a genetic change plays an important role

Bonder, M. J., Claringbould, A. & Deelen, P.

22/09/2021

Pers / media: Onderzoek ›

Coronacrisis vergroot de invloed DNA op gedrag en welbevinden

Deelen, P. & Franke, L.

09/06/2021

Pers / media: Expert Comment ›

Invloed DNA op gedrag en welbevinden tijdens coronacrisis steeds groter

Deelen, P. & Franke, L.

08/06/2021

Pers / media: Expert Comment ›

Opmerkelijk: DNA blijkt van invloed op gedrag en welbevinden tijdens coronacrisis, meldt UMCG

Deelen, P. & Franke, L.

08/06/2021

Pers / media: Expert Comment ›

Veni-beurzen voor veertien Groningse onderzoekers

van Borkulo, C., Deelen, P. & Drienovská, I.

05/11/2020

Pers / media: Overig ›

UMCG’ers ontvangen NWO-Veni van €250.000,-

Deelen, P., van der Hoorn, A. & van Borkulo, C.

05/11/2020

Pers / media: Onderzoek ›

Bekijk volledig onderzoeksprofiel
Volg de RUGfacebook linkedin rss instagram youtube
Functioneel
Biedt de basisfuncties en maakt gebruik van geanonimiseerde cookies.
Standaard
Biedt de optimale werking en maakt gebruik van onder andere videocookies.
Volledig
Biedt gepersonaliserde content en maakt gebruik van marketingcookies.
Stel je cookievoorkeur in. Lees onze privacy en cookie disclaimer voor meer informatie.