Skip to ContentSkip to Navigation
Over onsNieuws en agendaNieuwsberichten

Colloquium Mathematics, Dr. Maria Colomé Tatché

28 januari 2014

Join us for coffee and tea at 15.30 p.m.

Date:                        Tuesday, January 28th 2014
Speaker:                  
Maria Colomé Tatché, ERIBA| European Research Institute for the Biology of Ageing
                                 University of Groningen
Room:                       5161.0293 (Bernoulliborg)
Time:                        16.00

Title: Detection of genome-wide combinatorial epigenetic states

Abstract:

Epigenetics is the study of stable changes in gene expression that are not caused by changes in the DNA sequence. Epigenetic factors are for example responsible for making a skin cell look different from a brain cell, even though both cells have the same DNA sequence. The best-known epigenetic factors are DNA-methylation (addition of a methyl group to a cytosine nucleotide) and post-transcriptional modifications of histone proteins. The unique assembly and distribution of these epigenetic factors along the genome gives rise to specific gene expression programs that define the functional state of a cell. Next generation sequencing technologies allow us to measure the presence or absence of these epigenetic marks genome-wide. However, the statistical analysis and integration of these data is currently one of the major bottlenecks in computational biology.

In my talk I will outline our strategy for the genome-wide mapping of combinatorial epigenetic states based on multivariate Hidden Markov Models. This approach takes next generation sequencing data collected from different histone modifications as inputs and constructs well-defined sets of combinatorial states, which can be used for downstream functional analysis. Our method promises to deepen our basic understanding of the molecular processes underlying genome regulation.

Colloquium coordinators are Prof.dr. A.C.D. van Enter (e-mail : A.C.D.van.Enter@rug.nl) and Dr. A.V. Kiselev (e-mail: a.v.kiselev@rug.nl )

http://www.rug.nl/research/jbi/news/colloquia/mathematics-colloquia/

Laatst gewijzigd:06 juni 2018 14:04

Meer nieuws

  • 08 juni 2018

    Waardedaling woningen in aardbevingsgebied tot 2015 gemiddeld 9,3%

    Woningen in het Groningse aardbevingsgebied zijn tot 2015 gemiddeld 9,3% in waarde gedaald. Dat concluderen promovendus Nicolás Durán en hoogleraar Ruimtelijke Econometrie Paul Elhorst van de Rijksuniversiteit Groningen. Zij analyseerden data van de...

  • 06 juni 2018

    RUG op plek 120 in QS ranking

    De Rijksuniversiteit Groningen (RUG) staat dit jaar op plaats 120 in de QS World Top University Rankings 2019. Afgelopen twee jaar stond de RUG opplaats 113 in deze lijst van bijna 1.000 universiteiten wereldwijd. Op nationale schaal is Groningen dit...

  • 01 juni 2018

    Negen onderzoekers aan de RUG ontvangen een Vidi-beurs

    NWO heeft aan 86 ervaren onderzoekers ieder een Vidi-financiering van 800.000 euro toegekend. Maar liefst negen hiervan doen hun onderzoek aan de Rijksuniversiteit Groningen (RUG); aan vier verschillende faculteiten. Met de beurs kunnen de vier vrouwelijke...