Characterization of the Tm-2 locus of tomato and its durability
Promotie: dhr. I. Rasul, 11.00 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5, Groningen
Proefschrift: Characterization of the Tm-2 locus of tomato and its durability
Promotor(s): prof.dr. J. Hille
Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen
Onderzoek naar resistentie tegen tomaat- en tabakvirus
Tobamovirussen, zoals het Tomaten Mozaïek Virus (ToMV), zijn veelvoorkomende ziekteverwekkers op diverse gewassen. Ijaz Rasul heeft vier ToMV-resistentiegenen - één van tabak (N) en drie van tomaat (Tm-1, Tm-2 en Tm-22 ) - geïsoleerd, gekarakteriseerd en transgeen tot expressie gebracht. Hij deed dit in zowel tabak als tomaat. Het Tm-22 gen, dat een allel is van het doorbroken Tm-2 gen, geeft al bijna vijf decennia duurzame resistentie tegen de meeste tobamo virussen. De beide eiwitten verschillen slechts in vier aminozuren van elkaar, verspreid over twee domeinen. Domeinwisselexperimenten tussen de beide eiwitten en plaatsgerichte mutagenese laten zien dat één domein de specificiteit reguleert en het andere betrokken is bij signaaltransductie. Verder blijkt dat slechts één aminozuurverandering van het Tm-2 eiwit verantwoordelijk is voor de Tm-22 resistentiespecificiteit.
De extra-familieoverdracht van het Tm-22 gen naar Arabidopsis is ook bestudeerd door Rasul. Alhoewel de introductie van virusresistentie niet volledig bereikt is, zijn er wel aanwijzingen dat het gen tot expressie komt en gedeeltelijk functioneel is.
Om te zoeken naar nieuwe of Tm-22 homologe resistenties van buiten de agrarische genenpoel zijn 17 Solanum soorten onderzocht op ToMV-resistentie. Zes genotypen zijn geselecteerd voor verder moleculair onderzoek. Van alle zes genotypen konden genen worden geïsoleerd die lijken op het Tm-22 gen. Drie daarvan geven geen resistentie, twee lijken op het Tm-2 gen en één lijkt op een ingekort Tm-22 gen.
Voor toekomstig onderzoek kunnen de resultaten van de extra-familie Tm-22 gen verplaatsing in combinatie met de ingekorte Tm-22 genhomoloog van belang zijn. Dit kan leiden tot een beter begrip van interacties tussen plant en virus en kan de ToMV resistentiegenenpoel vergroten.
Ijaz Rasul (Pakistan, 1975) studeerde Plant Breeding and Genetics aan de University of Agricultuere in Faisalabad, Pakistan. Zijn promotieonderzoek deed hij aan de Rijksuniversiteit Groningen, bij de vakgroep Molecular Biology of Plants (MBP) van de afdeling Plantenfysiologie. Het werd deels gefinancierd door de Higher Education Commission (HEC) van Pakistan.
Laatst gewijzigd: | 13 maart 2020 01:01 |
Meer nieuws
-
16 april 2024
RUG ondertekent Barcelona Declaration on Open Research Information
De Rijksuniversiteit Groningen heeft de Barcelona Declaration on Open Research Information (Verklaring Open Onderzoeksinformatie) officieel ondertekend. Dit wordt gezien als een grote stap richting verantwoordelijke onderzoeksbeoordeling en open...
-
15 april 2024
Techniek single-molecule niche in Zwaartekrachtonderzoek
Met haar expertise in single-molecule technieken gaat Dr. Kasia Tych (GBB) bijdragen aan een groot Zwaartekracht-onderzoeksprogramma
-
15 april 2024
Nachtzicht met kunstmatige atomen
In Makers van de RUG belichten we elke twee weken een onderzoeker die iets concreets heeft ontwikkeld: van zelfgemaakte meetapparatuur voor wetenschappelijk onderzoek tot kleine of grote producten die ons dagelijks leven kunnen veranderen. Zo...