Biogeographical diversity of plant associated microbes in arcto-alpine plants

Diversiteit microben met associaties met twee pionier arctisch-alpine planten

Manoj Gopala Krishnan heeft onderzoek gedaan naar de diversiteit van microben die associaties hebben met twee pionier arctisch-alpine planten, Oxyria digyna en Saxifraga oppositifolia, uit drie geografische regio's: Mayrhofen, Oostenrijk (alpine klimaat), Kilpisjärvi, Finland (laag-arctisch klimaat) en Ny-Ålesund (hoog-arctisch klimaat).

Landplanten en microben zijn samen geëvolueerd sinds de opkomst van landplanten op aarde. Contacten met micro-organismen kunnen zowel nuttig als schadelijk zijn voor planten. Microben kunnen worden gevonden in de grond rond de wortels, maar ook in alle plantenweefsels zoals zaden. In arctisch-alpine gebieden, worden planten geconfronteerd met buitengewone uitdagingen, en, hoewel we veel weten over hun groei en overlevingsstrategieën, is er minder bekend over hun microbiomen. Het soort compartiment (bulkgrond, rhizosfeer grond, endosfeer) waarin de micro-organismen leven,  beïnvloedde de diversiteit en samenstelling van de gemeenschap van zowel schimmels en bacteriën. De endofytische gemeenschappen hadden de laagste diversiteit en de samenstellingen van hun gemeenschappen verschilden van die van de bulk en rhizosfeer grond. De geografische regio beïnvloedde de bacteriële en stikstoffixerende gemeenschappen significant in de bulkgronden, maar had een zwakkere invloed op de schimmelgemeenschappen van bulkgronden, die hoofdzakelijk werden gevormd door de pH van de bodem. De endosfeergemeenschappen  van schimmels en stikstoffixerende organismen werden ook beïnvloed door de regio, terwijl de totale bacteriële gemeenschappen in de endosfeer daarop in mindere mate reageerden. De samenstellingen van de bacteriële gemeenschappen in de endosfeer werden ook beïnvloed door het soort plant. De planten fungeren als effectieve ‘filters’, het selecteren van een beperkte groep van microben als endofyten uit de zeer diverse bodemgemeenschappen in de drie geografische regio's. De meeste van deze belangrijke taxa in de endosfeerbacteriomen kunnen een rol spelen bij de stikstofverwerving in deze lage-stikstofomgevingen.

Manoj Gopala Krishnan promoveert aan de RUG op onderzoek dat hij uitvoerde bij de afdeling Microbiële Ecologie van GELIFES. Het werd gefinancierd door NWO en e Academy of Finland. Hij vervolgt zijn loopbaan als postdoc aan de University of Jyvaskyla in India.

Proefschrift: http://hdl.handle.net/11370/f50b2750-96d1-4201-8603-4a7bc2441e14