Breaking bonds
| Promotie: | W.N. Sanchez Medina |
| Wanneer: | 16 juni 2025 |
| Aanvang: | 16:15 |
| Promotors: | prof. dr. A.J.M. (Arnold J M) Driessen, prof. dr. C.A.M. Wilson |
| Waar: | Academiegebouw RUG |
| Faculteit: | Science and Engineering |
Breekkrachten en hydrofobiciteit in signaalpeptide-sec complex interactie
Het Sec61-complex speelt een cruciale rol bij de eiwittranslocatie naar het endoplasmatisch reticulum (ER). Dit complex maakt de passage van oplosbare eiwitten naar het ER-lumen mogelijk en zorgt voor de laterale integratie van membraaneiwitten in het membraan. Het Sec-complex bestaat uit Sec61, Sec63, Sec62 en andere hulpeiwitten en is met name belangrijk voor de translocatie van precursor-eiwitten met inefficiënte signaalpeptiden (SP). Dergelijke SP hebben extra hulp nodig om de opening van het Sec61-kanaal te kunnen activeren.
Wendy Sanchez Medina onderzocht hoe de hydrofobiciteit van SP de interactie met het Sec-complex beïnvloedt. Sanchez Medina: 'Hiervoor hebben we een krachtspectroscopische benadering op één molecuul geoptimaliseerd en geïntegreerd met optische pincetten. We analyseerden drie SP met een lage, matige en hoge hydrofobiciteit in de h-regio. Onze resultaten tonen aan dat de zeer hydrofobe SP een minder stabiele binding vormt met het Sec-complex. Dit blijkt uit een kortere interactietijd en een verlaagde energiebarrière naar de ongebonden toestand. SP met een lagere hydrofobiciteit daarentegen vormen stabielere interacties, gekenmerkt door langere interactietijden en hogere energiebarrières.'
Deze bevindingen suggereren dat het Sec-complex in staat is SP selectief te herkennen en een interactie met hen aan te gaan op basis van hun hydrofobiciteit. Dit geeft inzicht in de mechanismen waardoor defecten in SP-translocatie bijdragen aan ER-gerelateerde ziekten.