Bioinformatics of genomic association mapping
| Promotie: | A. (Ahmad) Vaez Barzani |
| Wanneer: | 23 september 2015 |
| Aanvang: | 09:00 |
| Promotor: | prof. dr. H. (Harold) Snieder |
| Copromotors: | dr. B.Z. (Behrooz) Alizadeh, dr. I.M. Nolte |
| Waar: | Academiegebouw RUG |
| Faculteit: | Medische Wetenschappen / UMCG |
Nieuwe instrumenten voor analyse van het genoom
Bio-informatica is een vak in opkomst. Dit interdisciplinaire veld legt zich toe op het ontwikkelen en toepassen van methodes en software die bijdragen aan onze kennis over de levenswetenschappen. UMCG-onderzoeker Ahmad Vaez ontwikkelde een bio-informatisch stappenplan voor bio-informatica waarmee het menselijk genoom in kaart kan worden gebracht.
Bij zogeheten “veelvoorkomende complexe aandoeningen en eigenschappen” vindt interactie plaats tussen diverse genetische en omgevingsfactoren. Daarom is het lastig deze aandoeningen te koppelen aan specifieke afwijkingen in het genoom. De analyse van grote hoeveelheden data met behulp van bio-informatica biedt inzicht in de biologische mechanismen die aan deze aandoeningen en eigenschappen ten grondslag liggen.
Vaez stelde een volledig stappenplan op waarmee het verband tussen genetische merkers, dat zijn delen van DNA-sequenties, en specifieke aandoeningen in kaart kan worden gebracht. De eerste stap is een standaard erfelijkheidsanalyse. Daarna volgt de analyse van de associatie tussen genetische merkers en aandoeningen. Hiervoor gebruikt Vaez bestaande, maar ook enkele door hemzelf ontwikkelde instrumenten. Tot slot kunnen de bevindingen van deze analyses worden vertaald naar inzicht in de achterliggende biologische mechanismen. Vaez testte zijn stappenplan met succes op een menselijk eiwit.
Vaez concludeert dat bio-informatica een grote waarde heeft in de analyse van biologische data. De nieuwe instrumenten die hij voor dit doel ontwikkelde, zijn vrijelijk beschikbaar voor verdere toepassing binnen de wetenschappelijke gemeenschap.
Ahmad Vaez (1973) studeerde General Medicine. Hij verrichtte zijn promotieonderzoek bij de afdeling Epidemiologie en onderzoeksinstituut GUIDE van het UMCG, met financiële ondersteuning van het ministerie van Gezondheid en Medisch Onderwijs van de Islamitische Republiek Iran. Vaez wordt na zijn promotie Assistant Professor aan de Medische Universiteit van Isfahan.