Skip to ContentSkip to Navigation
Over onsMedische WetenschappenResearchKindergeneeskunde
University Medical Center Groningen

New key publication:Interplay of host genetics and gut microbiota underlying the onset and clinical presentation of inflammatory bowel disease

12 december 2017

Abstract

Objective Patients with IBD display substantial heterogeneity in clinical characteristics. We hypothesise that individual differences in the complex interaction of the host genome and the gut microbiota can explain the onset and the heterogeneous presentation of IBD. Therefore, we performed a case–control analysis of the gut microbiota, the host genome and the clinical phenotypes of IBD.

Design Stool samples, peripheral blood and extensive phenotype data were collected from 313 patients with IBD and 582 truly healthy controls, selected from a population cohort. The gut microbiota composition was assessed by tag-sequencing the 16S rRNA gene. All participants were genotyped. We composed genetic risk scores from 11 functional genetic variants proven to be associated with IBD in genes that are directly involved in the bacterial handling in the gut: NOD2, CARD9, ATG16L1, IRGM and FUT2.

Results Strikingly, we observed significant alterations of the gut microbiota of healthy individuals with a high genetic risk for IBD: the IBD genetic risk score was significantly associated with a decrease in the genus Roseburia in healthy controls (false discovery rate 0.017). Moreover, disease location was a major determinant of the gut microbiota: the gut microbiota of patients with colonic Crohn's disease (CD) is different from that of patients with ileal CD, with a decrease in alpha diversity associated to ileal disease (p=3.28×10−13).

Conclusions We show for the first time that genetic risk variants associated with IBD influence the gut microbiota in healthy individuals. Roseburia spp are acetate-to-butyrate converters, and a decrease has already been observed in patients with IBD.

Interplay of host genetics and gut microbiota underlying the onset and clinical presentation of inflammatory bowel disease.

Gut, 67(1), 108-119. DOI: 10.1136/gutjnl-2016-312135

Laatst gewijzigd:12 maart 2018 08:32

Meer nieuws

  • 11 september 2018

    Van Klokhuis-vraag naar Veni-subsidie

    Als kind was Jorrig Vogels al gefascineerd door taal en vergeleek hij de verschillende woorden voor ingrediënten op verpakkingen. Een jaar terug sleepte de taalonderzoeker een Veni-beurs in de wacht. ‘Taal heeft iets telepathisch: het beeld dat ík in...

  • 07 september 2018

    Constructief overleg – gezamenlijke overeenkomst

    Na een intensief en constructief gesprek met de actievoerende studenten van studentenpartij DAG en ROOD (jongeren SP) is donderdagavond een gezamenlijke overeenkomst bereikt op vier punten, vooral gericht op de lange termijn.

  • 04 september 2018

    Weg met die systeemplafonds

    Als Zuidlarens jongetje vond hij al die oude gebouwen in de stad Groningen maar niks. De interesse in historische panden kwam pas later, tijdens zijn studie Bouwkunde. Als bouwkundige is René Bosscher nu verantwoordelijk voor de buitenkant van de gebouwen...