A computational study on the nature of DNA G-quadruplex structure

Onderzoek naar viervoudige DNA structuren
DNA G-quadruplexen zijn hogere-orde structuren die bestaan uit zelf-assemblerende guanine-rijke oligonucleotiden. Deze DNA-structuren bestaan uit gestapelde vlakke G-kwartetten, een configuratie van cyclisch Hoogsteen-waterstofbinding bestaande uit vier guanine nucleobasen, die gestabiliseerd zijn in aanwezigheid van eenwaardige kationen. De identificatie van G-quadruplex-structuren in het menselijk-genoom, in het bijzonder oncogen-promotor gebieden en telomeren (de ‘kapjes’ die de uiteinden van een chromosoom beschermen), maakt ze tot een unieke doelwit voor de ontwikkeling van antikanker geneesmiddelen. Daarnaast hebben G-quadruplex-structuren veel aandacht getrokken vanwege hun regulerende functies in cellulaire processen, waaronder DNA-replicatie, transcriptie en translatie.
Naast hun belang voor geneesmiddelenontwikkeling en biologie zijn G-quadruplexen vanwege hun unieke structuur interessante bouwstenen voor de ontwikkeling van nanodevices. Het doel van het promotieonderzoek van Kiana Gholamjani Moghaddam was om met behulp van computationele technieken verschillende aspecten van systemen gebaseerd op G-quadruplexen te onderzoeken die de hierboven genoemde toepassingen hebben.
Het promotieonderzoek van Kiana Gholamjani Moghaddam vond plaats bij de afdeling Theoretische Chemie van het Zernike Institute for Advanced Materials met een beurs van de RUG.