Skip to ContentSkip to Navigation
Over onsMedische WetenschappenResearchDepartment of GeneticsStudents
University Medical Center Groningen

Student internships

This is a list of some recent students (stagestudenten) and their projects.

»Scroll down and click on the names that are underlined to see what the students thought about their internship in the department.
»Scroll down and click on the project titles that are underlined to see a summary of their project.

Name Projects 2017 Duration Supervisor
Christopher Marais and Sebastian Barnard, BSc students, Pretoria, S. Africa Scout of department to better understand the postgraduate and postdoctoral environment in the field of genetics 3 months Rolf Sijmons
Name Projects 2014 - 2016 Duration Supervisor
Roeland Broekema, MSc in Biomedical Sciences, UG Creating knock-outs of Celiac Disease associated loci using CRISPR/Cas9 3 months Iris Jonkers
Ineke Tan, MSc in Medicine, RUG Zoeken naar circulerende miRNAs die als vroege CeD biomarkers kunnen dienen more 6 months Sebo Withoff
Michiel Voskuil, MSc in Medicine, RUG Predicting response to anti-TNF therapy in inflammatory bowel disease more 6 months Rinse Weersma, Noortje Festen, Lieke Spekhorst
Carlos Urzua, MPDI, UG Allele-specific expression on gluten-sensitive T-cell clones 6 months Iris Jonkers
Wendy Knol, HBO Communicatie Onderzoek naar de implementatie van communicatie onder artsen en huisartsen op het gebied van farmacogenetica Rolf Sijmons, Cleo van Diemen
Annemirthe van Zanten, Medical student Voor mijn onderzoek zal ik met behulp van de verslagen van MRI hersenscans en EEG hersenfilmpjes kijken naar de prevalentie van neurologische afwijkingen bij kinderen met het Phelan‐McDermid syndroom (22q13.3 deletie), om zo de neurologische kenmerken van dit syndroom beter in kaart te brengen. Conny van Ravenswaaij, Renée Zwanenburg
Rosalie Baardman, Medical student Trends en veranderingen onderzoeken die zich de afgelopen dertig jaar hebben afgespeeld op het gebied van prenatale screening en diagnostiek voor het syndroom van Down Eurocat
Mariska Slofstra , Bioinformatics, Hanze University of Applied Sciences Developing an application for researchers to compare genotypes and phenotypes of patients with chromosome 6 aberrations using JavaScript more 5 months Mark de Haan
Roald Mulder, HBO Biologie en medisch laboratoriumonderzoek, Medische Diagnostiek Samenvoegen van SNParray- en NGS data in het programma Cartagenia, voor onderzoek naar recessieve ziektes waarbij CNV's en SNP's samen een rol zouden kunnen spelen Kirsten Abbott, Lennart Johansson
Louise Sleutel, HBO Biologie en Medisch Laboratoriumonderzoek Ik doe in een SCA 19 fruitvliegmodel onderzoek naar de invloed van het gemuteerde Kv4.3 eiwit (een kalium kanaal) op de werking van het wild type eiwit. Naar verwachting heeft de mutant een dominant negatief effect op de werking van dit eiwit. Ik word verantwoordelijk voor de vliegen en ga kruisingen inzetten om de eiwitten te activeren in het hele lichaam en in enkel de neuronen. Vervolgens zal ik een climbing en lifespan assay uitvoeren en de expressie meten dmv westernblot en qPCR. Dineke Verbeek
Daniela Ferreira Medeiros, HBO Biologie en Medisch Laboratoriumonderzoek In de diagnostiek wordt de array gebruikt om deleties en duplicaties vast te stellen. Dit is voor verschillende aandoeningen van belang, zoals patiënten met leukemie, bij een foetus met echoafwijkingen, kinderen met aangeboren afwijkingen/ ontwikkelingsachterstand. Niet altijd ontvangen wij voor de array kwalitatief voldoende en goed materiaal, of is het niet moeilijk uit het meest geschikte materiaal DNA te isoleren. Genome Diagnostics, Team 4
Samantha Zweers, HBO Biologie en medisch laboratorium onderzoek Research into spinocerebellar ataxia Dineke Verbeek
Naomi de Leeuw, Bedrijfskunde MER (Management, Economie en Recht) Doelmatigheidsonderzoek naar een mogelijke implementatie van een e-healthprogram Clinical genetics section, Tanya Halbersma-Konings
Sander van den Hoek,
Bio-informatica, Hanzehogeschool Groningen
De mogelijkheid en efficientie van een Hadoop/MapReduce implementatie voor de NGS pipeline. Dit zal zich voornamelijk richten op het uitvoeren van de alignment en SNP calling Genomics Coordination Center, Freerk van Dijk
Tjitske Buisman, Applied Psychology Developing a questionnaire for couples taking or not taking the preconception screening test to investigate the psychological impact of the test and ethical issues ELSI group
Denise Blom, Applied Psychology Validation of English GCOS questionnaire for Dutch research ELSI group
Valerie Collij, BSc in
Medicine, UG
Drug repositioning in inflammatory bowel disease based on genetic information more 6 months Noortje Festen, Rinse Weersma

Name Projects 2011 - 2014 Duration Supervisor
Dyah Perwitasari Development of a pharmacogenetic assay for Indonesian TBC patients 2 months Pieter van de Vlies
Yalan Bi, MSc, Molecular Biology and Biotechnology, Univ of Groningen eQTL analysis in human disease 5 months

Yang Li

Amer de Haan, MSc Linking lncRNAs to celiac disease

Sebo Withoff/Zuzanna Borek

Jens Seidel, HBO, Van Hall Larenstein Hogeschool, Leeuwarden Study of the T352P mutation in KCND3/Shal, which is related to spinocerebellar ataxia type 19, using a Drosophila melanogaster model of this disease Anna Duarri
Dirk de Weerd, HBO, Bioinformatics, Hanze University of Applied Sciences

Automated NIPT diagnostics pipeline. The development of an automated Non Invasive Prenatal Test analysis pipeline using MOLGENIS compute framework

Dirk de Weerd's poster on NIPT won a prize in the Hanze University's Institute of Life Science and Technology poster competition. Dirk was an intern in the Genomics Coordination Centre from January - September 2014. His project was to develop the Non-Invasive Prenatal Test (NIPT) pipeline in compute 5.

9 months Morris Swertz
Alejandra Hernandez Segura, Top Masters, Univ. of Groningen Investigating the role of lncRNAs in celiac disease pathogenesis 7 months Cisca Wijmenga/Vinod Kumar

Melissa Boerrigter

New mutations in KCNC3 and their functional effect in spinocerebellar ataxia type 13

5 months Dineke Verbeek, Esther Nibbeling

Matthieu Beukers, BSc in Bioinformatics, Hanzehogeschool

Functional annotation of imputed eQTL loci using different molecular data sources; Conservation of lncRNA

Morris Swertz, Patrick Deelen, GCC
Paskal van Norel, HLO Next Generation Sequencen - Targeted resequencing van 73 genen betrokken bij erfelijke vormen van kanker 7 wks Petra Grootscholten
Irene van Loppersum, Life sciences, Hogeschool InHolland, Amsterdam

The role of the T352P mutation in Shal/Kv4 transgenic Drosophila model for the human disease spinocerebellar ataxia type 19

6 months Dineke Verbeek, Anna Duarri

Kees Nederveen, HBO

Biological age determination using sjTREC’s and telomere length

5 months Sasha Zhernakova
Anastassia Blanter

Comparing different methods of measuring cell senescence

5 months Sasha Zhernakova
Sigrid Pilot Overexpression and knockdown of PBRM1 in clear cell renal cell cancer lines (ccRCC) 6 months Klaas Kok
Angela Kuik, HLO Aantonen van mutaties in de tumorsuppressorgenen PBRM1 en SETD2in clear cell Renal Cell Carcinoma 10 months Klaas Kok
Laatst gewijzigd:21 februari 2017 11:03