Skip to ContentSkip to Navigation
Over ons Praktische zaken Waar vindt u ons dr. S. (Sebo) Withoff

Speerpunten

Ik onderzoek hoe iemands genetische aanleg (DNA) en niet-coderende RNA moleculen (micro-RNAs (miRNAs) en long non-coding RNAs (lncRNAs)) bijdragen aan de kans op het krijgen van complex genetische, immuun-gemedieerde ziekten zoals Coeliakie, Inflammatoire Darm Ziekte (IBD), Non-alcoholische Steatohepatitis (NASH) en Multipele Sclerose (MS).

Ik gebruik voornamelijk patientenmateriaal en cellijnmodellen als modelsystemen voor ziektes die ik manipuleer en uitlees met de nieuwste 'genomics technologien' zoals bijvoorbeeld CRISPR/Cas9, SNP (single nucleotide polymorphism) arrays, single-cell RNA sequencing, single-cell ATACseq, en oLINK targeted proteomics.

Recentelijk focus ik op de ontwikkeling van organen-op-chip platforms. Hiertoe gebruik ik patientencellen die ik genetisch reprogrammeer tot zogenaamde induced pluriptent stem cells (iPSCs) en die ik op hun beurt differentieer tot darmwandcellen, immuuncellen, bloedvatcellen, of levercellen. De microfluidische darm-op-chip of lever-op-chip systemen die ik vervaardig zijn de meest veelbelovende modelsystemen voor 'personlized medicine' applicaties en onderzoeksvraagstellingen omdat de uitgangscellen zijn verkregen van patienten, wat betekend dat de erfelijke aanleg die aan de basis van de ziekte ligt aanwezig is.

Publicaties

iPSC-derived organ-on-a-chip models for personalized human genetics and pharmacogenomics studies

Phage display sequencing reveals that genetic, environmental, and intrinsic factors influence variation of human antibody epitope repertoire

Gut mucosa dissociation protocols influence cell type proportions and single-cell gene expression levels

Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Pediatric Coeliac Disease Patients Suggests Potential Pre-Seroconversion Markers

A Combined mRNA- and miRNA-Sequencing Approach Reveals miRNAs as Potential Regulators of the Small Intestinal Transcriptome in Celiac Disease

Circulating miRNAs as Potential Biomarkers for Celiac Disease Development

Inflammatory Protein Profiles in Plasma of Candidaemia Patients and the Contribution of Host Genetics to Their Variability

Integration of metabolomics, genomics, and immune phenotypes reveals the causal roles of metabolites in disease

Long Non-Coding RNAs Involved in Progression of Non-Alcoholic Fatty Liver Disease to Steatohepatitis

Non-classical clinical presentation at diagnosis by male celiac disease patients of older age

Lees meer

Pers/media

An update on the intestine-on-chip and liver-on-chip programs at the UMCG

Glutenintolerantie onderzoeken met minidarmpjes

Darmen op een chip

Iris Jonkers and Sebo Withoff

Grootse plannen met piepkleine organen.

Lees meer