The dynamics of root microbiomes along a salt marsh primary succession

Dynamiek wortelgeassocieerde microbiomen op kwelder 

Miao Wang heeft zich in haar proefschrift gericht op de vraag of planten een sterkere invloed uitoefenen op de selectie van wortelgeassocieerde microbiomen dan de fysische en chemische eigenschappen van de bodem en een antwoord gezocht door analyse van herhaalde monsters van dezelfde plantensoort in een natuurlijke gradiënt van bodemtypes in de primaire successie van de kwelder van Schiermonnikoog.

Vanwege het belang van plant-microbe interacties voor het functioneren van ecosystemen is het essentieel om de ‘drivers’ van de wortel-geassocieerde microbiële gemeenschappen te bepalen. Het is bekend dat zowel de eigenschappen van de bodem als die van de gastheerplant een belangrijke rol spelen in het bepalen van de compositie en functioneren van de wortelgeassocieerde microbiële gemeenschappen. De selectieve kracht van de plant op het wortelmicrobioom kan variëren per locatie, aangezien de bodemeigenschappen, die de assemblage van de microbiële gemeenschappen in de bodem bepalen, variëren per bodemtype. Echter, de geobserveerde verschillen kunnen ook ontstaan als gevolg van verschillen in microbiële biogeografische patronen. I De bevindingen verhogen onze kennis van de variatie in structuur en functies van de rhizosfeergemeenschappen langs de bodemvorming en van het effect die plantselectie uitoefent op endofietgemeenschappen. In het bijzonder de talrijke functionele profielen behorende bij deze endofieten, onafhankelijk van het bodemeffect in de kwelder, duidde op een selectie van (collectieve) eigenschappen, maar niet op selectie langs fylogenetische lijnen. Zo’n eigenschapgebaseerde selectie is in overeenstemming met de veronderstelde invloed van plant-microbe interacties op de vestiging van planten, en zodoende met het functioneren van ecosystemen en successiepatronen.

Proefschrift: http://hdl.handle.net/11370/65bc6cdc-e06c-4515-a13a-bb672d6392ce