Publication

Resolving local structures and dynamics of proteins with 2D IR spectroscopy

Roy, S., 2012, Groningen: s.n.. 190 p.

Research output: ThesisThesis fully internal (DIV)Academic

Copy link to clipboard

Documents

  • Theses

    Final publisher's version, 135 KB, application/octet-stream

  • Chapter 1

    Final publisher's version, 248 KB, PDF document

  • Chapter 2

    Final publisher's version, 429 KB, PDF document

  • Chapter 3

    Final publisher's version, 555 KB, PDF document

  • Chapter 4

    Final publisher's version, 497 KB, PDF document

  • Chapter 5

    Final publisher's version, 635 KB, PDF document

  • Chapter 6

    Final publisher's version, 576 KB, PDF document

  • Chapter 7

    Final publisher's version, 476 KB, PDF document

  • Chapter 8

    Final publisher's version, 123 KB, PDF document

  • English summary

    Final publisher's version, 150 KB, PDF document

  • Dutch summary

    Final publisher's version, 160 KB, PDF document

  • Acknowledgements

    Final publisher's version, 73 KB, PDF document

  • Complete dissertation

    Final publisher's version, 2 MB, PDF document

  • Theses

    Final publisher's version, 49 KB, PDF document

  • Santanu Roy
Infraroodlaser volgt eiwit 3D-structuur van stap tot stap tijdens een reactie Eiwitten zijn met hun vele mechanische en biochemische functies, essentiële onderdelen van organismen. Zo zorgt elastine voor elasticiteit in levende wezens en worden chemische reacties in organismen gekatalyseerd en geactiveerd door enzymen. Voor de functie van een eiwit is de structuur ervan erg belangrijk. Deze structuur ontstaat doordat het eiwit zich spontaan vouwt in een drie-dimensionale structuur met de minste vrije energie. Als dit proces leidt tot een verkeerde structuur, kan dit ziekten als de ziekte van Alzheimer, de ziekte van Parkinson, diabetes type II en kanker veroorzaken. Om te begrijpen hoe een eiwit functioneert, is het dus erg belangrijk om de structuur ervan te achterhalen. Het achterhalen van deze structuur tijdens een biochemische reactie is een grote uitdaging. Dit komt doordat er verschillende processen plaatsvinden op verschillende tijdschalen, variërend van één seconde tot één biljardste van een seconde. Wij hebben een methode ontwikkeld die ultrasnelle structuurveranderingen (één miljardste seconde) kan oplossen. Voor deze methode worden computersimulaties gecombineerd met experimenten waarin infraroodlasers worden gebruikt om de moleculaire vibraties van het eiwit te kunnen meten. Deze methode kan worden gebruikt om tijdens een reactie zowel de verschillende tussenvormen van een eiwit als de tijdschaal waarmee deze van structuur verandert te kunnen identificeren.
Original languageEnglish
QualificationDoctor of Philosophy
Supervisors/Advisors
Award date21-Sep-2012
Place of PublicationGroningen
Publisher
Print ISBNs9789036757195
Publication statusPublished - 2012

    Keywords

  • Proefschriften (vorm), Eiwitten, Density function theory, Moleculaire $dynamica, Trillingen, Chemische $structuur, Infraroodspectrometrie, Lokale analyse (wiskunde), Tweedimensionale systemen, eiwitten, nucleïnezuren

Download statistics

No data available

ID: 14516274