Skip to ContentSkip to Navigation
Over onsNieuws en agendaNieuwsberichten

Bacterial response to ecological opportunities offered by soil fungi

04 december 2009

Promotie: J.A.S. Warmink, 14.45 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5, Groningen

Proefschrift: Bacterial response to ecological opportunities offered by soil fungi

Promotor(s): prof.dr. J.D. van Elsas

Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen

Contact: Jan Warmink, tel. 050-363 2272, e-mail: warmink@gmail.com

Reactie bacteriën op ecologische mogelijkheden geboden door bodemschimmels

Voor de vruchtbaarheid van de grond is het microbiële leven heel belangrijk. Het microbiële bodemleven is betrokken bij de belangrijkste biochemische cycli, vooral bij de afbraak van organisch materiaal tot nieuwe voedingsstoffen voor planten en andere organismen. Dit maakt de studie van dit deel van de microbiologie interessant voor de landbouw. Maar, vanwege de diversiteit van het bodemleven is het tevens een intrigerend onderzoeksobject voor de fundamentele (micro)biologie. Jan Warmink richtte zijn promotieonderzoek voornamelijk op het beter begrijpen van de interactiemechanismen tussen bacteriën en schimmels, die binnen de microbiële gemeenschap in de grond een zeer belangrijke rol spelen.

Eén van de potentiële mechanismen om als bacterie te kunnen profiteren van de schimmelgastheer kan het zogenaamde ‘type III secretion system’ (TTSS) zijn. Veel bacteriële ziekteverwekkers bij plant, dier en mens maken gebruik van dit mechanisme voor de infectie van hun gastheer. Warmink ontdekte dat er een verhoudingsgewijze significante toename van TTSS-positieve bacteriën was onder invloed van een schimmel. Deze vondst geeft aan dat bacteriën met het TTSS in het voordeel zijn ten opzichte van bacteriën zonder dit mechanisme. Daardoor kon hij ook aantonen dat TTSS een rol kan spelen in interacties tussen bacterie en schimmel, wat tot nu toe onbekend was. Bacteriën kunnen ook gebruik maken van schimmeldraden voor verplaatsing door de bodem. Deze eigenschap is uitermate belangrijk voor de vitaliteit van het bodemleven, omdat nuttige bacteriën via deze weg verspreid kunnen worden. Er zijn sterke aanwijzingen gevonden dat het TTSS een rol speelt in deze verplaatsing.

Jan Warmink (Gieten, 1978) studeerde Plantbiotechnology aan de Wageningen Universiteit. Zijn promotieonderzoek deed hij aan de Rijksuniversiteit Groningen, bij de vakgroep Microbiële ecologie van het Centre for Ecological en Evolutionary Studies (CEES). Inmiddels werkt hij als wetenschappelijk medewerker bij Sylphium Life Sciences in Groningen.

Microbial life plays an important role in the fertility of soil as it is involved in the most important biogeochemical cycli in soil. This makes research in this field of microbiology important for agriculture and - due to the complex structure of soil life - also for fundamental microbiology. Fungi and bacteria play a very important role within the microbial community of soil. Jan Warmink focussed his study mainly on increasing our understanding of the interactions between the two species in soil. One of the potential bacterial mechanisms allowing these to benefit from the fungal host can be the so-called “type III secretion system (TTSS). This mechanism is often involved in the infection of humans, animals and plants by bacterial pathogens. By Warmink a significant increase was found for TTSS-harbouring bacteria that are under the influence of soil fungi in contrast to those in soil without fungi. According to these findings, bacteria with TTSS have an advantage when associated with soil fungi, in contrast to bacteria lacking this mechanism. Thus, TTSS plays a role in bacterial-fungal interactions in soil, a fact hitherto unknown in the literature.

Warmink’s research also showed the possibility of bacteria to use fungal hyphae for transportation through soil. This property is potentially very important for the biological functioning of soil, as beneficial bacteria can be dispersed in this way. Warmink found strong evidence for a role of TTSS in this bacterial transport. Transport of the beneficial bacteria via fungal hyphae through soil in biocontrol and plant growth promotion stimulation applications can lead to a reduction of pesticides and fertilizers in agriculture.
Laatst gewijzigd:15 september 2017 15:38
printOok beschikbaar in het: English

Meer nieuws