On the kinetics and conformational dynamics of elevator transporters
| Promotie: | Dhr. G. (Gianluca) Trinco |
| Wanneer: | 27 augustus 2021 |
| Aanvang: | 11:00 |
| Promotors: | prof. dr. D.J. (Dirk) Slotboom, prof. dr. B. (Bert) Poolman |
| Waar: | Academiegebouw RUG |
| Faculteit: | Science and Engineering |
Dynamiek en kinetiek van twee transporteiwitten
Gianluca Trinco bestudeerde de transport kinetiek en dynamiek van twee secundair actieve membraan transporteiwitten die respectievelijk aspartaat en citroenzuur over de membraan transporteren met behulp van een natrium ionen gradiënt, GltTk en Cits. Voor eiwitten die een transport reactie uitvoeren waarbij de concentraties gelijk blijven (steady state kinetics) zoals GltTk hebben heeft Trinco met de gemeten transport snelheden van verschillende substraten en mede getransporteerde ionen de kinetische parameters kunnen uitrekenen. Voor eiwitten die juist snel evenwicht (rapid equilibirum) kinetiek volgen zoals CitS, heeft hij met de gemeten transport snelheden de volgorde van binding van substraat en mede getransporteerde ionen kunnen uitrekenen.
Verder laat Trinco zien met behulp van High-speed scanning Atomic Force Microscopie dat er gedurende transport drie metastabiele toestanden van CitS zijn. Ook heeft hij met kristallografie de 3D structuur van GltTk gebonden aan D-aspartaat bepaald. Als laatste bestudeerde Trinco de rol van een geconserveerde methionine in GltTk door transport snelheden van verschillende mutanten te meten.
Het promotieonderzoek van Gianluca Trinco vond plaats bij de afdeling Enzymologie van het Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (GBB) met financiering van de RUG.