Deciphering the pneumococcal cell cycle

Nieuwe inzichten voor bestrijding resistente bacterie

Streptococcus pneumoniae (de pneumokok) is een bacterie die gevonden wordt in de kelen van gezonde mensen, maar ook miljoenen doden per jaar veroorzaakt. Steeds vaker is de pneumokok resistent tegen antibiotica en de huidige vaccins beschermen tegen niet alle verschillende types pneumokokken. Daarom is het nodig om op zoek te gaan naar nieuwe aanknopingspunten. Een manier is het identificeren van nieuwe genen die belangrijk zijn voor groei en/of celdeling in de pneumokok.

Er bestaan verschillende methodes om essentiële eiwitten te identificeren door het verstoren van elk gen, maar het valideren hiervan is vaak een langdurig proces. Daarom ontwikkelde Clément Gallay een snelle en betrouwbare methode, gebaseerd op CRISPRi, om elk essentieel gen in de pneumokok te inactiveren en bestuderen. Zo kon hij de functie van een aantal onbekende genen specifiek voor S. pneumoniae ontrafelen.

Potentiele doelwitten voor antibiotica vormen genen die betrokken zijn bij de celcyclus. Er is weinig bekend over hoe de pneumokok detecteert wanneer het DNA kan gaan dupliceren. Met behulp van zijn onderzoeksgegevens heeft Gallay een nieuw eiwit geïdentificeerd dat zich ophoot daar waar de celdeling plaatsvindt. Het eiwit stimuleert DNA-replicatie één keer per celcyclus. Daarnaast laat hij zien hoe belangrijk lipidebiosynthese is voor de groei en vorm van de pneumokok. Samen verbreden deze bevindingen onze kennis van de regulatie van de celcyclus van de pneumokok, en kunnen ze helpen om nieuwe doelwitten voor antimicrobiële therapie te ontwikkelen.

Het promotieonderzoek van Clément Gallay vond plaats bij de afdeling Moleculaire Genetica van het Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (GBB), met financiering via NWO en de Swiss National Science Foundation (SNSF). Hij werkt nu als postdoc aan de Universiteit van Lausanne (Zwitserland).

Proefschrift: http://hdl.handle.net/11370/9da26944-1c8d-4492-8855-ec065f782c2e