Computational studies of influenza hemagglutinin
| Promotie: | Dhr. S. (Sander) Boonstra |
| Wanneer: | 22 december 2017 |
| Aanvang: | 11:00 |
| Promotors: | prof. dr. ir. E. (Erik) van der Giessen, prof. dr. ir. P.R. (Patrick) Onck |
| Waar: | Academiegebouw RUG |
| Faculteit: | Science and Engineering |
Eerste stap griepvirus-infectie onderzocht
Hemagglutinine (HA) is een eiwit aan de buitenkant van de membraan van het influenzavirus. Het zorgt voor de eerste stappen die nodig zijn om het griepvirus een cel te laten binnendringen. HA zorgt hierbij voor het binden van het virus aan de cel en voor het samensmelten van het virale membraan met het celmembraan. Dit maakt het een logisch doel voor het afweersysteem en voor tegen virussen gerichte medicijnen.
Het samensmelten van twee membranen is thermodynamisch gezien een gunstig proces, hoewel het een hoge activeringsenergie heeft en via meerdere tussenstappen verloopt. Het onderzoek van Sander Boonstra richtte zich vooral op de moleculaire details van de vormveranderingen in het HA eiwit die het membraanfusieproces katalyseren. Hij laat zien hoe met behulp van moleculaire dynamica simulaties de interacties tussen aminozuren zijn gevonden die belangrijk zijn voor het juist functioneren van HA. Ook berekende hij de hoeveelheid vrije energie die een HA eiwit kan leveren.
Het promotieonderzoek van Sander Boonstra vond plaats bij de afdeling Micromechanica van het Zernike Institute for Advanced Materials, dat zijn werk ook financierde.